上回书说到，慕容墨轩为了逃避世界的追杀，将灵魂分成了4份，将4份灵魂送到4个不知名的世界。而这里讲述地就是慕容墨轩本体的故事。
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在慕容墨轩刚刚降临到这个世界南极的时候，包裹着慕容墨轩的巨大岩石，撞上了发光的巨人，那巨人竭力抵御，殊不知，那块岩石的特性之一，就是吸收各种能量，再加上慕容墨轩经受了时空乱流的折磨，十分虚弱，需要巨大的能量来补充自身缺失的能量。
于是乎，无论是巨人装逼外放的能量，还是自身保留的能量，都被慕容墨轩吸了个八成，而慕容墨轩吃饱了喝足了，变沉睡在南极血色的海洋里（南极已经被搞没了）消化多余的能量。
南极大陆上发生了一起给地球带来巨大浩劫的异变。立时，海面水位上升，地轴扭曲，天灾四起，经济瓦解……几日内，世界人口锐减了二分之一……南极，成为了宁静的残亡地域。
人类，并未象恐龙那样灭绝，但复兴的工作，却无比严峻。饱受了惊惶与疲劳的人们，将这场灾难沉重的浩劫，称之为“第二次冲击”。
第二次冲击后，位于日本相模湾边的箱根地区下的巨大球形空间内，成百万吨的沙土被移走，地表中装置了二十二层装甲防护，可谓是固若金汤，人类进化研究所就以此为基地，这里被叫做“第三新东京市”
但是此时，第三新东京市却是诡异的空无一人，原因只是因为那一遍一遍播报声，很播报的是单一的警告。“从今日12点30分开始，对以东海为中心的关东、中部地区，宣布进入特殊紧急状态。各位居民请立刻到指定避难所避难。再重复一次。从今日12点30分开始。。。”而冷清呢，是因为这宽阔的街道上一个人都没有。马路上随处可见开着车门启动着的汽车。可车子里面却空无一人。想必是都跑到避难所避难了吧。
好吧，准确来说还有一个少年，在打电话，不过当然了，这种情况下怎么可能打得通嘛。
少年无奈地挂断了电话摇了摇头，掏出一张照片，照片上是一个年轻女子，穿着吊带衫加超短裤，而且姿势极具有满诱惑。弄得少年脸微微一红。那就是，这是他要等的人，可惜还没有来。
嗖。。。嗖。。。
少年还没反应过来。一道道破空声便擦着少年的耳朵传来。旁边的电缆也被那破空声吹得呼呼作响。是导弹！看导弹的样子是朝着山后飞去。
砰！砰！轰……轰……轰隆！！
导弹在后山炸开，街道被炸得粉身碎骨，而后一架一下架的无人战斗机从后山鱼贯而出，随后便传来了巨一阵阵巨大的脚步声，不过多时，脚步声的主人出现了，那是一个巨大的人形生物，与小山差不多高。
通体黝黑，胸口镶嵌着一个红色的球体球体旁边，有骨刺防护，两片厚重的肩甲护住了双肩，在球体上方有一个类似面具的东西充当了头。无人战斗机的火力全开，但是对于这个人形生物貌似没有实质性的伤害。
那人形生物，看着向自己不断攻击的无人战斗机，面具歪了一下，貌似是在疑惑，又或者是在卖萌（额，你确定？），不过下一秒确定了，它绝对不是在卖萌，只见他伸出了手臂，手掌射出一道长枪似的激光，狠狠地击穿了一架战斗机。战斗机如同折翼的鸟儿一般向少年所在的地方落下去。在看人形生物，它的上方出现了一个类似天使光环的东西，随后便飞了起来，向战斗机落下的地方飞去一脚踩爆。
爆炸就发生在少年的旁边。作为一个新手小白，少年果断腿软了。
吱…呀…
正在少年腿软之际，一阵刺耳的刹车声响起，一辆蓝色的跑车漂移到少年的跟前，替他挡下了爆炸所产生的冲击。车门打开。里面坐着一个身穿无袖黑色制服，带着蝙蝠框墨镜，一头深蓝色如夜空般深邃的秀发，一脸自信的微笑，英姿飒爽的年轻女子开口道。“抱歉，让你久等了。碇真嗣对吧”
“是的，你是葛城美里小姐？”说话间，少年动作也不减慢，废话，要是慢了小命都保不住，以最快的速度上车关门，年轻女子，额，不对，葛城美里没有再说什么，漂亮的一个摆尾，躲开了人形生物的大脚，车尾灯闪出了华丽的光芒，向远方驶去，离开了这片“不毛之地”。
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nerv总部。
不明生物正朝基地方向前进，确认目标形象，切换到主屏幕上，一阵阵报告声传来。
周围磁场异常，正在进行精密测定，根据光学结果进行最优先验证作业。
“时隔15年了啊。”一个略带回忆的声音。
“啊，错不了。”一个冷漠的声音响起。“是使徒！”
如果小碇此时在这里的话，一定会一眼就能认出这两个人；正是号称万年冰山的碇源渡和万年跟班的冬月
目标还健在，目前继续向第三新东京市前进，又是一串报告声。很明显那些个无人战斗机好像没有办法阻止使徒的前进。
“发动总攻！把所有兵力全派出去”联合国将军紫藤铭浩，大喊一声的说道。（这个名字好熟悉呀，好像之前也是个跑龙套的来着）
“别在乎什么损失，我无论如何也要将目标击毁！”副将军伊藤铭浩也是愤怒的咆哮着，说话间还捏碎了手中写报告的铅笔。
无人机，坦克，穿甲弹，响尾蛇跟踪导弹以及